DNA i vore celler udsættes løbende for beskadigelse. Hvis skaderne ikke repareres kan resultatet blive celledød eller sygdom, inklusive cancer og neurologiske sygdomme. Heldigvis indeholder celler mekanismer, under et kendt som ’the DNA Damage Response’ (DDR), der reparerer DNA skader og samtidig dæmper cellens tendens til vækst og nysyntese, så længe reparationen foregår. I de seneste år har det vist sig, at udover proteiner, spiller RNA molekyler også en afgørende rolle. Projektforslaget tager sigte på at analysere funktionen af sådant RNA i DDR. Tidligere studier fra vort laboratorium har afsløret, at der syntetiseres RNA i afgrænsede områder foran de fleste gener. Dette RNA bliver normalt hurtigt nedbrudt, men kan stabiliseres, enten ved at fjerne nedbrydningsmaskineriet eller ved at igangsætte DDR med ultraviolet bestråling. Dette medfører, at det nabostillede gen inaktiveres. Et lignende fænomen er beskrevet i et enkelt tilfælde for CCND1 genet. I dette tilfælde viste det sig, at RNAet kunne rekruttere et hæmmende protein til CCND1-genets regulatorregion, hvilket medførte inaktivering af genet. Min hypotese er, at dette fænomen er et generelt respons i forbindelse med DNA beskadigelse, således at gener bliver holdt i en inaktiv tilstand medens de bliver repareret. Jeg ønsker derfor – i analyser, der omfatter samtlige cellens gener - at studere, hvordan disse RNA molekyler stabiliseres og hvordan dette medfører nedlukning af aktive gener under DNA reparation.